در پی ارتحال آیت الله حاج آقا مجتبی تهرانی، رهبر معظم انقلاب اسلامی در پیام تسلیتی، درگذشت آن عالم عامل ربانی و معلم اخلاق را ضایعهای برای حوزهی علمیه و روحانیت و جامعهی مذهبی تهران خواندند و این مصیبت را به بازماندگان بیت شریف ایشان تسلیت گفتند. متن پیام حضرت آیت الله خامنهای به این شرح است: بسم الله الرحمن الرحیم با تأسف و تأثر فراوان، خبر درگذشت عالم عامل ربّانی، مرحوم آیت الله آقای حاج آقا مجتبی تهرانی رحمت الله علیه را دریافت کردم. این حادثه ناگوار، ضایعهای برای حوزهی علمیه و روحانیت و جامعهی مذهبی تهران و به ویژه ارادتمندان و شاگردان ایشان و جوانانی است که از مجالس پر فیض و درسهای سازندهی این معلم اخلاق بهره میبردند. اینجانب تسلیت صمیمانهی خود را به آن بیت شریف و بازماندگان، بویژه اخوی بزرگوار و نیز به همسر مکرّم و آقازادگان ارجمند و دیگر بازماندگان این بیت شریف تقدیم داشته، علوّ درجات آن فقید سعید را از خداوند متعال مسألت مینمایم. نماز رهبر انقلاب بر پیکر آیت الله مجتبی تهرانی در مدرسه شهید مطهری مراسم تشییع پیکر پاک آیت الله تهرانی همزمان با اربعین سید و سالار شهیدان حضرت اباعبدالله الحسین علیه السلام روز پنجشنبه ۱۴ دیماه ۱۳۹۱، از ساعت ۸ صبح در مدرسه عالی شهید مطهری واقع در میدان بهارستان برگزار میشود و رهبر معظم انقلاب اسلامی، حضرت آیةالله العظمی خامنهای دامت برکاته بر پیکر ایشان اقامه نماز خواهند فرمود. همچنین مجلس بزرگداشتی از سوی معظمله روز جمعه از ساعت ۱۰ صبح در محل حسینیه امام خمینی(ره) برگزار خواهد شد. مراسم دیگری از سوی بیت آیةالله العظمی حاج آقا مجتبی تهرانی روز شنبه از ساعت ۹ تا ۱۱ صبح در مسجد جامع بازار تهران برپا خواهد شد.